法律分析：公司克扣工资，劳动者可以通过以下方：与用人单位协商；向调解组织申请调解；到当地的劳动监察大队投诉；到当地人力资源社会保障局劳动人事争议仲裁委员会申请劳动仲裁；对仲裁裁决不服的，向人民提起诉讼。
法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》
第三十条 用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民申请支付令，人民应当依法发出支付令。
第四十四条 有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：
一、安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬。
二、休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。
三、法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
