1、的印制要求不同：根据新的《税收征管法》第二十二条规定：专用由税务主管部门指定的企业印制；其他，按照主管部门的规定，分别由省、自治区、直辖市国家税务局、地方税务局指定企业印制。未经前款规定的税务机关指定，不得印制。
2、使用的主体不同：专用一般只能由一般纳税人领购使用，小规模纳税人需要使用的，只能经税务机关批准后由当地的税务机关代开；
3、的内容不同：专用除了具备购买单位、销售单位、商品或者服务的名称、商品或者劳务的数量和计量单位、单价和价款、开票单位、收款人、开票日期等普通所具备的内容外，还包括纳税人税务登记号、不含金额、适用税率、应纳额等内容。
4、的联次不同：专用有四个联次和七个联次两种，第一联为存根联（用于留存备查），第二联为联（用于购买方记账），第三联为抵扣联（用作购买方扣税凭证），第四联为记账联（用于销售方记账），七联次的其他三联为备用联，分别作为企业出门证、检查和仓库留存用；普通则只有三联，第一联为存根联，第二联为联，第三联为记账联。
