分居三年可以解除婚姻关系。如果双方对于是否离婚、孩子抚养权、财产分割等内容达成一致意见，可以随时去民政部门协议离婚，不能达成合意，只能诉讼离婚。
起诉离婚的流程是什么？
1、起草起诉状；
2、准备诉讼所需要的证据；
3、向有管辖权的递交起诉状和证据；
4、决定是否受理该诉讼；
5、受理该离婚诉讼案件之后，在法定时间内向对方发送起诉状副本；
6、安排开庭时间并向双方发送传票；
7、开庭。双方均可以委托律师或者其他专业人士代理诉讼；
8、依照原告方的诉讼请求和双方提交的证据情况，对是否准予离婚，以及如何分割财产，子女抚养问题如何解决等问题作出判决。
综上所述，以夫妻感情破裂为前提分居满2年就可以离婚，分居两年以上包含分居三年，可以解除婚姻关系，会直接判决离婚。双方感情破裂，可以直接办理离婚手续，如果双方对财产分割、子女抚养等达不成一致意见的，可以起诉到离婚。
【法律依据】：
《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民提起离婚诉讼。
人民审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
